Saat ini perkembangan pondok pesantren di wilayah Kota Pekalongan secara kuantitas maupun kualitas dinilai cukup baik. Namun ada satu pondok pesantren di Wilayah Sapuro - Kebulen yang berhenti beroperasional karena semakin berkurangnya jumlah santrinya.

Staff Pendidikan Pondok Pesantren Kementrian Agama setempat, Muttaqin menjelaskan, Pondok Pesantren Al Iman Kebulen dibawah asuhan Kyai Haji  Amin menyampaikan laporan ke Kantor Kementrian Agama jika ponpes telah berhenti beroperasi.

Muttaqin kepada Radio Kota Batik mengatakan, selain karena jumlah santri yang semakin berkurang setelah meninggalnya pengasuh pondok pesantren regenerasi pengurus juga berhenti sehingga mempengaruhi operasional pondok.

Dijelaskan, hingga saat ini jumlah pondok pesantren aktif di Kota Pekalongan mencapai sebanyak 41 pondok dengan jumlah santri mencapai sebanyak 4ribuan yang tersebar di seluruh wilayah Kota Pekalongan.

(Tri Handayani-Dirhamsyah)